(資料圖片僅供參考)
美國研究人員使用人工智能(AI)來設(shè)計超越自然界的新蛋白質(zhì)。他們開發(fā)的機器學(xué)習(xí)算法,可生成具有特定結(jié)構(gòu)特征的蛋白質(zhì),這些蛋白質(zhì)可用于制造具有特定機械性能(如剛度或彈性)的材料,從而取代作為原料的石油或陶瓷。研究論文發(fā)表在最新一期《化學(xué)》雜志上。
麻省理工學(xué)院、IBM沃森AI實驗室和塔夫茨大學(xué)研究人員采用了一種生成模型,其與DALL-E 2等AI系統(tǒng)中使用的機器學(xué)習(xí)模型架構(gòu)相同,但研究人員調(diào)整了模型架構(gòu),以預(yù)測實現(xiàn)特定結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)的氨基酸序列。
這一模型學(xué)習(xí)控制蛋白質(zhì)形成方式的生化關(guān)系,產(chǎn)生超越自然界的新蛋白質(zhì),從而實現(xiàn)獨特應(yīng)用,例如,該工具開發(fā)的食品涂層可使農(nóng)產(chǎn)品保鮮時間更長,同時保證食用安全。該模型還可在幾天內(nèi)就生成數(shù)百萬種蛋白質(zhì),為科學(xué)家迅速提供可供探索的新可能。
研究人員此次構(gòu)建了兩個機器學(xué)習(xí)模型,以預(yù)測各種新氨基酸序列,這些氨基酸序列形成滿足結(jié)構(gòu)設(shè)計目標的蛋白質(zhì)。一種模型在蛋白質(zhì)的整體結(jié)構(gòu)特性上起作用,另一種模型在氨基酸水平上起作用。兩種模型都通過組合這些氨基酸結(jié)構(gòu)來產(chǎn)生蛋白質(zhì)。
這些模型與預(yù)測蛋白質(zhì)折疊的算法相關(guān)聯(lián),研究人員使用該算法來確定蛋白質(zhì)的3D結(jié)構(gòu)。然后,他們計算其結(jié)果屬性,并根據(jù)設(shè)計規(guī)范檢查這些屬性。測試顯示,其與現(xiàn)有氨基酸序列存在部分重疊,在大多數(shù)情況下約有50%—60%,但也有一些全新的序列。相似程度表明,AI生成的許多蛋白質(zhì)是可合成的。
關(guān)鍵詞: